一、突出问题
　　受小农经济体制和公益性投资少的限制，下列突出问题致使我国柑橘产业化优势未能形成，小生产与大市场的矛盾突出。
　　1、安全意识淡薄（顾眼前、顾自己、种苗乱、用药多）。
　　2、单产水平较低（0.5吨/亩，是美国的1/5）。
　　3、成熟期太集中（95%集中在10-12月）。
　　4、品种结构不合理（甜橙仅占30%，巴西为90%，美国为70%）。
　　5、知名品牌很少（好的不多，多的不好）。
　　6、商品化格调低（产后处理能力弱，附加增值少）。
　　我国由于安全生产意识淡薄和公益性投资缺乏，检疫性有害生物随苗木携带进非疫区的现象时有发生，每年因柑橘检疫性等有害生物造成10%以上的产量损失，同时造成鲜果的内质和感观下降，严重影响市场销售与出口。这与美国、西班牙、澳大利亚等国形成巨大反差，这些国家充分利用世界贸易组织（WTO）的“绿箱政策”和“黄箱政策”，大力投资建设公益性基础性设施，建立了较完备的柑橘生产安全保障和支撑体系。

　　二、主要对策。
　　随着经济的发展，针对上述突出问题，农业部等有关部门采取了一系列对策，近年来对公益性基础性设施和项目投资力度不断加强，同时鼓励龙头企业介入柑橘产业。
　　1、引进优新品种（1998-2002年，农业部组织实施了全国柑橘“948”项目，从国外引进一批新品种）。
　　2、建设良繁体系（2000-2003年，农业部在中国农科院柑橘所投资建设“国家柑橘苗木脱毒中心”并与国务院三峡建设委员会共同投资建立“一级采穗圃”，在华中农大建设“国家果树脱毒种质资源室内保存中心”并与国务院三建委共同投资建立“一级采穗圃”，在部分柑橘主产区建设“省级无病毒柑橘良种苗木繁育场”和“二级采穗圃”）。
　　3、规划优势区域（2002年，农业部规划出我国三条柑橘优势产业带和一批特色基地：以加工甜橙为主的长江上中游带、以脐橙为主的赣南湘南桂北带、以宽皮柑橘为主的浙南闽西粤东带）。此外，还规划一批特色基地。
　　4、加强品种选育（2002-2003年，农业部在中国农科院柑橘所投资建设“国家柑橘品种改良中心”和“国家柑橘种质资源圃的保护和开发利用项目”，在华中农大建设“国家柑橘育种中心”）。
　　5、建设示范基地（2003-2004年，农业部投资在重庆、湖北和江西建设3000亩的高标准示范园，国务院三建委在重庆和湖北三峡库区建设3万亩示范园）。
　　6、引进龙头企业（推行“公司+基地+农户”投资模型，产业链条不断延伸。近年涌现出一批龙头企业，正加大投资力度介入柑橘产业化建设，如国内企业：黄岩罐头厂、汇源集团、三峡建设集团、赣南果业、椰风集团、娃哈哈集团、现代超大农业集团、禾嘉和聚和集团等，外资企业：美国施格兰公司、澳门恒河集团、新加坡复发中记、南非Outspan、澳大利亚Vitor等）。
　　7、建设安全体系（2002-2003年，农业部制定柑橘质量安全行动计划，加强农业部柑橘质检中心和部分省级柑橘质检中心建设，在成都建立“西部地区区域性重点植物检疫实验室和国外引种隔离试种场”，在广州建立“东南部地区区域性重点植物检疫实验室和国外引种隔离试种场”）。